Essais d’isolement et d’identification des souches bactériennes à pouvoir auto-épurateur vis-à vis des hydrocarbures
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Date
2016
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Abstract
Le littoral algérien est exposé à plusieurs types de pollution, y compris celle des
hydrocarbures. Cet environnement riche en huile pourrait être la source de la prolifération des
bactéries hydrocarbonoclastes. L'objectif de l'étude était d'isoler et d'identifier les souches
bactériennes indigènes des eaux marines de deux ports de la côte Est et de tester leur
croissance en présence d'hydrocarbures avec et sans biostimulation tout au long de la prise
d'azote et de phosphate. Cinquante-trois souches bactériennes ont été identifiées, dont quatre
ont été sélectionnées pour effectuer les tests de croissance. Les résultats ont montré que la
croissance et la biodégradation diffèrent d'une espèce à l'autre. Ainsi, les souches testées
(Halomonas venusta NY-8, Exiguobacterium aurantiacum NB11-3A, Vibrio alginolyticus
Pb-WC11099 et Dietzia sp. CNJ898 PL04) ont été très actives, ce qui a permis d'obtenir une
meilleure croissance avec les deux dernières souches pendant la supplémentation en azote et
phosphate. De telles souches sont suggérées de participer beaucoup à la biodégradation du
pétrole sur les sites pollués.
Les souches les plus performantes ont été identifiées en utilisant les caractères
morphologiques, microscopiques, les galeries biochimiques ainsi que par méthodes
moléculaires à travers l’ADNr 16S. Enfin, Une analyse par le logiciel MEGA5.05 a permis de
générer une matrice de distance élaborée par comparaison des séquences d’ADN selon la
méthode de Neighbors joining. Cette matrice est ensuite représentée sous forme d’un arbre
phylogénétique. Des analyses de bootstrap avec 1000 itérations ont été effectuées pour
vérifier la robustesse de l’arbre.
Le dosage des hydrocarbures avant et après croissance des souches testées a révélé
que toutes les souches semblent dégrader les hydrocarbures avec des taux différents. Ainsi, la
dégradation maximale est obtenue avec Halomonas venusta strain NY-8 en présence de
heptane, suivi par la dégradation d’hexane avec Exiguobacterium aurantiacum strain
NB11_3A de Vibrio alginolyticus PB- WC 11099 avec heptane et Dietzia sp CNJ898
PLO4 avec l’essence