Evaluation de la résistance des bacilles à Gram négatif aux antibiotiques « Bactéries isolées dans l’est algérien »
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Date
2016
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Abstract
La résistance aux antibiotiques chez les bacilles à Gram négatif reste un problème important en
Algérie et permet de devenir une préoccupation clinique majeure à l'avenir, par conséquent la
surveillance locale continue de la résistance aux antibiotiques est cruciale. L’objectif de cette
étude est d’évaluer l’apparition et de déterminer le support génétique de la résistance aux
antibiotiques chez les bacilles à Gram négatif isolés en milieu hospitalier dans trois villes de
l’est Algérien :Annaba , Skikda et Guelma .
Une collection de 186 souches ( entérobactéries 161 (84.4%) et 25 (13.3%) des bacilles à Gram
négatif non fermentants) a été effectuée durant la période du mois de Mars 2013 jusqu’ au mois
de Mars 2015 , l’identification a été faite par la galerie API 20 (NE ou E) et par (MALDI-TOF
MS). L’antibiogramme a été réalisé selon les recommandations du comité de la société française
de microbiologie par la méthode de la diffusion des disques sur un milieu gélosé . Les
concentrations minimales inhibitrices ont été déterminées par E-test. Les souches résistantes
aux carbapénèmes ont été soumises aux différents tests phénotypiques : test d’Hodge, EDTA, et
le Carba NP modifiée. La détermination des gènes de résistance ont été caractérisés par (PCR et
séquençage) en utilisant: (blaTEM , blaSHV, blaCTX-M et bla OXA-48, blaKPC , blaNDM, bla OXA-23,
blaOXA-24 , blaOXA-58 , blaVIM ) et le géne OprD . Enfin, l’étude de la clonalité par la technique
Multi-locus Sequence Typing (MLST).
Toutes les souches ont montré un haut niveau de résistance à tous les antibiotiques
principalement aux B-lactamine. Trente-six sur 186 (19,3%) étaient résistants aux
carbapénèmes. Parmi eux, 11 hébergent les gènes de carbapénèmase : blaOXA-48 (2 Klebsiella
pneumoniae), blaVIM-4 (2 Pseudomonas aeruginosa), blaNDM-1 (2 Acinetobacter baumannii) et
blaOXA-23 (5 A. baumannii), d'autres ß-lactamases aussi ont été détectés: blaCTX-M- (15/66/139)
,
blaSHV- (28/85/1/133) et blaTEM-1. Toutes les P. aeruginosa imipenème résistante porte des mutations
dans l’ OprD, nous les divisons en 5 groupes (G1,G2,G3,G4,G5).
Le MLST a démontré la présence de ST( 404 , 219) en K. pneumoniae, ST 2 et ST 85 en A.
baumannii et ST (244, 1076, 241, 227 et 233) en P. aeruginosa. L’Analyse de la clonalité a
montré une épidémie provoquée par le ST 244 chez P. aeruginosa dans le service des brulés à
Annaba et aussi une épidémie par le ST 1076 dans l’est Algérien.
Finalement, la détection de souches productrices de carbapénémases est essentielle, tant pour la
prise en charge thérapeutique que pour la prévention et le contrôle de l’infection. En effet, les
infections par ces souches étant associées à des taux de mortalité et de morbidité plus élevés, les
reconnaître chez un patient donné peut aider à adapter l’antibiothérapie