Sensibilité aux antibiotiques et profil moléculaire des bactéries responsables d’infections respiratoires basses
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Date
2014
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Abstract
Les pneumonies nosocomiales sont la principale cause d'infection nosocomiale dans les unités de soins
intensifs, elles sont liées à la ventilation artificielle. Les bactéries responsables d'infections nosocomiales au
cours de la ventilation mécanique sont essentiellement les bacilles à Gram négatif (BGN): Acinetobacter
baumannii, Pseudomonas aeruginosa et les entérobactéries. La résistance aux antibiotiques des BGN est
devenue un problème majeur de santé publique.
L’objectif de ce travail est d’évaluer le taux, le support génétique de la résistance aux antibiotiques et
l’épidémiologie moléculaire d’une série de 95 de souches bactérienne (42 souches d’entérobactéries ,23
d’A. baumannii , 22 P. aeruginosa et 8 S. aureus) responsables de pneumonie isolées dans le laboratoire de
microbiologie du centre hospitalo-universitaire, Dr Dorban Annaba, Algérie, entre Janvier 2010 et Octobre
2011, par des techniques phénotypiques et génotypiques.
L’identification des souches a été effectuée par Api 20E, Api 20NE, Api Staph et MALDI-TOF Le test de
sensibilité aux antibiotiques a été réalisé par la méthode de diffusion de disque su milieu gélosé, les
concentrations minimales inhibitrices (CMIs) des souches résistantes ont été déterminées par la technique
de dilution en milieu gélosé et E-test. Les gènes codants pour les β-lactamases ont été recherchés par des
outils de biologie moléculaire (PCR standard, PCR en temps réel, séquençage). La détermination des
relations entre les souches clonales a été réalisée par électrophorèse en champ pulsé (PFGE) après macro restriction par l'enzyme Apa1.
Toutes les souches ont montré un haut niveau de résistance à tous les antibiotiques testés principalement
aux β-lactamines sauf les P. aeruginosa qui ont présenté un faible taux de résistance aux antibiotiques, les
valeurs des concentrations minimales inhibitrices obtenues ont montrés: entérobactéries (Cefotaxime
CMI50≥4048 mg/l) et imipeneme CMI50 =128 µg/ml pour A. baumannii. Le séquençage des produits
d'amplification de gènes bla a montré la présence du gène CTX-M15 (86,95%), SHV-11(23,80%), SHV-12
(38%), TEM-1 (4,76%) chez nos souches d'entérobactéries ce qui explique le taux élevé de résistances aux
β-lactamines.
La résistance des A. baumannii aux carbapénemes est liée à la sécrétion de plusieurs carbapénemases
essentiellement OXA-23 (60.86%). D’autre carbapénemases ont été trouvées : OXA-24, OXA-58 et NDM-1.
La dissémination des CTX-M-15 et OXA-23 dans le service de réanimation est liée à la possibilité de
transfert horizontale de ces gènes et la capacité de ces bactéries à acquérir de nouveau gènes. Nos
résultats signalent l’urgence de contrôler la diffusion des BMR et la prescription des antibiotiques en ville et
à l’hôpital.